集中治療室では、あらゆる原因によって生命の危機に瀕している重症患者の治療を行っています。そのような重症病態では、免疫が過剰に反応することから全身性炎症反応症候群を発症します。近年、遺伝子（DNA、RNA）や遺伝子産生物（たんぱく質、代謝産物）を網羅的に評価することが可能となってきました。本研究の目的は、網羅的分子情報に基づいて全身性炎症反応症候群の新規分子病態を解明することです。これから、将来的に個々の重症患者に最適な個別化医療の実現を目指します。
急性期ゲノムプロジェクトの業績一覧
1.Ito H, Ebihara T, Matsumoto H, Oda J. Relationship between growth differentiation factor 15 and functional prognosis and severity in traumatic brain injury. (Sci Rep. 2025; 15:2470). doi: https://doi.org/10.1038/s41598-025-87062-z
2.Sakakibara S, Liu YC, Ishikawa M, Edahiro R, Shirai Y, Haruna S, El Hussien MA, Xu Z, Li S, Yamaguchi Y, Murakami T, Morita T, Kato Y, Hirata H, Takeda Y, Sugihara F, Naito Y, Motooka D, Tsai CY, Ono C, Matsuura Y, Wing JB, Matsumoto H, Ogura H, Okada M, Kumanogoh A, Okada Y, Standley DM, Kikutani H, Okuzaki D. Clonal landscape of autoantibody-secreting plasmablasts in COVID-19 patients. Life Sci Alliance. 2024 Sep 17;7(12):e202402774. doi: 10.26508/lsa.202402774. PMID: 39288992; PMCID: PMC11408605.
3.Okita T, Kita S, Fukuda S, Kondo Y, Sakaue TA, Iioka M, Fukuoka K, Kawada K, Nagao H, Obata Y, Fujishima Y, Ebihara T, Matsumoto H, Nakagawa S, Kimura T, Nishizawa H, Shimomura I. Soluble T-cadherin secretion from endothelial cells is regulated via insulin/PI3K/Akt signalling. Biochem Biophys Res Commun. 2024 Nov 5;732:150403. doi: 10.1016/j.bbrc.2024.150403. Epub 2024 Jul 14. PMID: 39047402.
4.Muratsu A, Oda S, Onishi S, Yoshimura J, Matsumoto H, Togami Y, Mitsuyama Y, Ito H, Okuzaki D, Ogura H, Oda J. Bacterial sepsis causes more dramatic pathogenetic changes in the Th1 pathway than does viral (COVID-19) sepsis: a prospective observational study of whole blood transcriptomes. Virol J. 2024 Aug 19;21(1):190. doi: 10.1186/s12985-024-02451-6. PMID: 39160575; PMCID: PMC11334310.
5.Priest DG, Ebihara T, Tulyeu J, Søndergaard JN, Sakakibara S, Sugihara F, Nakao S, Togami Y, Yoshimura J, Ito H, Onishi S, Muratsu A, Mitsuyama Y, Ogura H, Oda J, Okusaki D, Matsumoto H, Wing JB. Atypical and non-classical CD45RBlo memory B cells are the majority of circulating SARS-CoV-2 specific B cells following mRNA vaccination or COVID-19. Nat Commun. 2024 Aug 9;15(1):6811. doi: 10.1038/s41467-024-50997-4. PMID: 39122676; PMCID: PMC11315995.
6.Metwally H, Elbrashy MM, Ozawa T, Okuyama K, White JT, Tulyeu J, Søndergaard N, Wing JB, Muratsu A, Matsumoto H, Ikawa M, Kishi H, Taniuchi I, Kishimoto T. Threonine phosphorylation of STAT1 restricts interferon signaling and promotes innate inflammatory responses. Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Apr23;121(17):e2402226121. doi: 10.1073/pnas.2402226121. Epub 2024 Apr 15. PMID: 38621137; PMCID: PMC11046697
7.Tachino J, Togami Y, Matsumoto H, Matsubara T, Seno S, Ogura H, Oda J. Plasma Proteomics Profile-Based Comparison of Torso Versus Brain Injury: A Prospective Cohort Study. J Trauma Acute Care Surg. 2024 Apr 10. doi:10.1097/TA.0000000000004356. Epub ahead of print. PMID: 38595266.
8.Mitsuyama Y, Matsumoto H, Togami Y, Oda S, Onishi S, Yoshimura J, Murtatsu A, Ito H, Ogura H, Okuzaki D, Oda J. T cell dysfunction in elderly ARDS patients based on miRNA and mRNA integration analysis. Front Immunol. 2024 Mar 20;15:1368446. doi: 10.3389/fimmu.2024.1368446. PMID: 38571958; PMCID: PMC10987699.
9.Tachino J, Seno S, Matsumoto H, Kitamura T, Hirayama A, Nakao S, Katayama Y, Ogura H, Oda J. Association between tranexamic acid administration and mortality based on the trauma phenotype: a retrospective analysis of a nationwide trauma registry in Japan. Crit Care. 2024 Mar 19;28(1):89. doi: 10.1186/s13054-024-04871-w. PMID: 38504320; PMCID: PMC10953216.
10.Yoshimura J, Togami Y, Ebihara T, Matsumoto H, Mitsuyama Y, Sugihara F, Hirata H, Okuzaki D, Ogura H. Classification of patients with COVID-19 by blood RNA endotype: a prospective cohort study. Microbiol Spectr. 2023 Dec12;11(6):e0264523. doi: 10.1128/spectrum.02645-23. Epub 2023 Nov 15. PMID:37966347; PMCID: PMC10715063.
11.Kawakami E, Saiki N, Yoneyama Y, Moriya C, Maezawa M, Kawamura S, Kinebuchi A, Kono T, Funata M, Sakoda A, Kondo S, Ebihara T, Matsumoto H, Togami Y, Ogura H, Sugihara F, Okuzaki D, Kojima T, Deguchi S, Vallee S, McQuade S, Islam R,Natarajan M, Ishigaki H, Nakayama M, Nguyen CT, Kitagawa Y, Wu Y, Mori K, Hishiki T, Takasaki T, Itoh Y, Takayama K, Nio Y, Takebe T. Complement factor Dtargeting protects endotheliopathy in organoid and monkey models of COVID-19. Cell Stem Cell. 2023 Oct 5;30(10):1315-1330.e10. doi:10.1016/j.stem.2023.09.001. PMID: 37802037; PMCID: PMC10575686.
12.Kanki H, Matsumoto H, Togami Y, Okuzaki D, Ogura H, Sasaki T, Mochizuki H.Importance of microRNAs by mRNA-microRNA integration analysis in acute ischemic stroke patients. J Stroke Cerebrovasc Dis. 2023 Sep;32(9):107277. doi: 10.1016/j.jstrokecerebrovasdis.2023.107277. Epub 2023 Aug 8. PMID: 37562178.
13.Onishi S, Matsumoto H, Sugihara F, Ebihara T, Matsuura H, Osuka A, Okuzaki D,Ogura H, Oda J. Combination of HBA1, TTR, and SERPINF2 in plasma defines phenotype correlated with severe burn outcome. iScience. 2023 Jul 3;26(8):107271. doi: 10.1016/j.isci.2023.107271. PMID: 37502255; PMCID: PMC10368932.
14.Inoue T, Shinnakasu R, Kawai C, Yamamoto H, Sakakibara S, Ono C, Itoh Y, Terooatea T, Yamashita K, Okamoto T, Hashii N, Ishii-Watabe A, Butler NS,
Matsuura Y, Matsumoto H, Otsuka S, Hiraoka K, Teshima T, Murakami M, Kurosaki T. Antibody feedback contributes to facilitating the development of Omicron- reactive memory B cells in SARS-CoV-2 mRNA vaccinees. J Exp Med. 2023 Feb 6;220(2):e20221786. doi: 10.1084/jem.20221786. Epub 2022 Dec 13. PMID: 36512034; PMCID: PMC9750191.
15.Ito H, Ishikawa M, Matsumoto H Sugihara F, Okuzaki D, Hirata H, Ogura H.Transcriptional differences between coronavirus disease 2019 and bacterial sepsis. Virol J. 2022 Nov 28;19(1):198. doi: 10.1186/s12985-022-01930-y. PMID:36443881; PMCID: PMC9702864.
16.Ebihara T, Matsubara T, Togami Y, Matsumoto H, Tachino J, Matsuura H, KojimaT, Sugihara F, Seno S, Okuzaki D, Hirata H, Ogura H. Combination of WFDC2,CHI3L1, and KRT19 in Plasma Defines a Clinically Useful Molecular Phenotype Associated with Prognosis in Critically Ill COVID-19 Patients. J Clin Immunol. 2023 Feb;43(2):286-298. doi: 10.1007/s10875-022-01386-3. Epub 2022 Nov 4. PMID: 36331721; PMCID: PMC9638294
17.Tachino J, Matsumoto H, Sugihara F, Seno S, Okuzaki D, Kitamura T, Komukai S,Kido Y, Kojima T, Togami Y, Katayama Y, Nakagawa Y, Ogura H. Development of clinical phenotypes and biological profiles via proteomic analysis of trauma patients. Crit Care. 2022 Aug 6;26(1):241. doi: 10.1186/s13054-022-04103-z. PMID: 35933364; PMCID: PMC9357328.
18.Togami Y, Matsumoto H, Yoshimura J, Matsubara T, Ebihara T, Matsuura H,Mitsuyama Y, Kojima T, Ishikawa M, Sugihara F, Hirata H, Okuzaki D, Ogura H. Significance of interferon signaling based on mRNA-microRNA integration and plasma protein analyses in critically ill COVID-19 patients. Mol Ther Nucleic Acids. 2022 Sep 13;29:343-353. doi: 10.1016/j.omtn.2022.07.005. Epub 2022 Jul 13. PMID: 35855895; PMCID: PMC9278015.
急性期ゲノムプロジェクトの新着ニュース
- 2023年1月24日
- Roche INFECTIOUS DISEASE AWARD 2022に選ばれました
- 2022年7月08日
- 第28回外科侵襲とサイトカイン研究会の優秀演題セッションで口頭発表しました
急性期ゲノムプロジェクトの最近の実績
- 2025年3月18日
当講座の貫和亮太招へい教員、松本寿健特任助教らの研究チームは小田紗矢香先生、奥崎大介准教授（IFReC ヒト免疫学（単一細胞ゲノミクス））らと、夜勤従事医師を対象に夜勤前後での全血トランスクリプトーム解析を行い、夜勤後に自然免疫応答を中心とした炎症反応が生じ、シフト勤務による健康リスクに関与している可能性を示しました。（J Intensive Care. 2025 Mar 11;13(1):14.）
- 2025年1月16日
当講座の伊藤弘特任助教らは、頭部外傷患者の血漿を用いた解析から増殖因子であるGDF-15はSOFAスコアと関連していることを明らかにし、全身の重症度の指標になる可能性があることを報告いたしました。(Sci Rep. 2025; 15:2470)
- 2024年8月31日
当講座の蛯原健 特任助教、松本寿健 特任助教らは、大阪大学医学系研究科 内分泌・代謝内科学 沖田朋憲 医員、福田士郎 助教、喜多俊文 招聘准教授、下村 伊一郎教授らとの共同研究で、膵臓β細胞の増殖を促進する、可溶性のT-カドヘリンは内皮細胞から分泌され、インスリンによって制御が行われていることを明らかにしました。(Biochem Biophys Res Commun. 2024 Jul 14;732:150403）
- 2023年10月10日
- 当科の蛯原健 特任助教、戸上由貴医師（現大阪医療センター）、松本寿健 特任助教、小倉裕司 准教授らは、大阪大学ヒューマン・メタバース疾患研究拠点（WPI-PRIMe）の武部貴則 教授、東京医科歯科大学 統合研究機構 先端医歯工学創成研究クラスター 創生医学コンソーシアム 佐伯憲和 プロジェクト助教らとの共同研究で、補体代替経路を増幅するD因子に着目し、D因子を阻害する半減期延長型抗D因子抗体を用いて新型コロナウイルス感染モデルの血管炎症状の軽減に成功しました（Cell stem cell. 2023）
- 2023年10月02日
当科の松本寿健 特任助教は、神経内科・脳卒中科 招へい教員 神吉 秀明先生（現大阪警察病院 脳神経内科部長）と神経内科学 特任教授 佐々木 勉 先生らとの共同研究で、急性期の重症脳卒中において、全血mRNAとmiRNAの統合解析を行い、マクロファージにおけるMSP-RONシグナル伝達が活性化され、複数のmiRNAが脳卒中病態を包括的に制御していることを明らかにしました（J Stroke Cerebrovasc Dis. 2023）。
